1、利用MALDI-TOF/TOF对于药物小分子的高通量研究 2、基于MALDI-TOF/TOF的高通量SNP基因分型研究 3、自上而下的蛋白质完整测序研究TOP-Downsequecing 4、蛋白质翻译后修饰研究，比如蛋白质磷酸化研究 5、多组样本差异蛋白质的相对定量，非标记和标记差异蛋白质组学