透射式电子显微镜因电子束穿透样品后，再用电子透镜成像放大而得名。它主要用于观察样品表面或内部的形貌结构。透射电镜具有放大倍数更高、分辨率高等特点。在实际使用主要用以观察超薄切片中细胞和细胞器的超微结构，从而进行细胞生理、病理及其它形态学分析。对生理和病理学、寄生虫学和细胞学等各项研究工作有很大帮助。同时还能进行生物，高分子材料的微观研究。