气质联用仪结合气相的高效分离能力和质谱的强大定性能力，主要用于小分子量，易挥发，且热稳定性好的有机化合物的分析和研究，进行高效的定性、定量分析，适用于有机合成中的溶剂残留分析，天然产物中农药残留及挥发油等的分析，环保中的气体分析等，在天然产物、精细化工、催化科学、有机合成及环境研究等诸多领域有着广泛的应用。